גדוד 968 הוקם ב-1972 כגדוד הק"ח (הגנת רקע חילית) בבסיס עציון (כנף 10). במהלך מלחמת יום הכיפורים הגדוד השתתף במרדפים אחר חוליות מודיעין מצריות. במלחמת שלום הגליל ב־1982 סופחה פלוגה אחת של הגדוד לדובר צה"ל וליוותה את הכתבים הצבאיים שיצאו לסיורי שטח. יתר הפלוגות ליוו ואיבטחו שיירות אספקה. הגדוד ביצע תעסוקה מבצעית לא אורגנית ברצועת עזה וביהודה ושומרון. ב־1998 החל הגדוד להשתתף באבטחת פריסות של מערך הנ"מ ותרגילי ג'וניפר קוברה. הגדוד כפוף לכנף 168. במהלך נגיף הקורונה בישראל השתתף הגדוד בשינוע בדיקות קורונה מנקודות בדיקה למעבדות.[90]
מפקדים: סא"ל יואב שניצר (1985–1990), סא"ל חיים כהן (1990–1994), סא"ל חזי גוטמן (1994–1999), אל"ם משה חביביאן (1994–).[91][92]