| תפקיד | מפקד | תקופת פיקוד | אירועים מיוחדים |
| מפקד פיקוד הנ״מ | אל״ם בוריס אל-דור (סניור) | 1950 – 1951 | הקמת פיקוד הנ״מ ופירוקו. |
| קצין תמ״ח
(קצין תותחי נ״מ חילי בחה"א) |
סא״ל יואל פארן (פרנק) | 1951 – 1956 | מבצע קדש, קליטת 40 מ"מ (אל-60), קליטת 3.7 אינטש |
| קצין תמ"ח | סא״ל דוד גורן (גרינשפן) | 1956 – 1958 | מימוש לקחי קדש וקליטת תותחי 30 מ"מ |
| קצין תמ"ח | סא"ל אהרון דגן (שפק) | 1958 – 1960 | הקרב על המים ופליטת 40 מ"מ (אל-60) |
| קצין תמ"ח | סא"ל יוסף תירוש (שטראוס) | 1960 – 1962 | מימוש לקחי קדש, |
| קצין תמ"ח | סא"ל יהודה בירן (בירנבאום) | 1962 – 1964 | קליטת תותחי 40 מ"מ (אל-70), תקרית תל דן |
| קצין תמ"ח | סא"ל מרדכי בר מור (בישביין) | 1964 – 1966 | ביסוס מערך ה-40 מ"מ |
| קצין תמ"ח | סא״ל משה תמיר (לנגר) | 1966 – 1969 | מלחמת ששת הימים, מלחמת ההתשה, הקמת מערכי שלל. |
| קטק"א
(קצין טילי קרקע־אוויר) |
סא"ל אריה גור | 1965 – 1968 | קליטת הוק, מלחמת ששת הימים, מלחמת ההתשה |
| קטק"א | סא"ל אפרים רונן | 1968 – 1970 | מלחמת ההתשה, ביסוס מערך ההוק |
| קהנ"מ
(קצין הגנת נ״מ) |
אל״ם משה תמיר | 1970 – 1972 | העברת הנ"מ מחת"ם לחיל האוויר, הקמת מערכי השלל, הקמת המערך המתנייע |
| קהנ"מ | אל״ם מאיר שריב (שרייבר) | 1972 – 1977 | מלחמת יום הכיפורים, קליטת דרקון וחובט, הקמת ביסנ"מ 883 |
| מכהנ"מ
(מפקד כוחות הנ״מ) |
תא״ל רוניה לפיד (לייפר) | 1977 – 1982 | מלחמת שלום הגליל, קליטת בזק |
| מכהנ"מ | תא״ל מאיר שריב | 1982 – 1984 | המשך הפעלת המערך במלחמת לבנון הראשונה. |
| מכהנ"מ | תא״ל איתן יריב | 1984 – 1988 | תחילת פעילות קו סגול, צמצום מערך המילואים ופליטת מערכי השלל |
| מכהנ"מ | תא״ל אורי רם | 1988 – 1991 | מלחמת המפרץ הראשונה, קליטת ברקן |
| מכהנ"מ | תא״ל יצחק בירן | 1991 – 1994 | קליטת היהלום |
| מכהנ"מ | תא״ל גלעד רמות | 1994 – 1998 | פליטת מערך ה-40 מ"מ (אל-70) |
| מכהנ"מ | תא״ל אריה פישביין | 1998 – 2000 | קליטת חץ, קליטת המחבט, שילוב נשים לוחמות |
| מכהנ"מ | תא״ל יאיר דורי | 2000 – 2003 | טרור אווירי, חומת מגן |
| מכהנ"מ | תא״ל אילן ביטון | 2003 – 2006 | מלחמת לבנון השנייה |
| מכהנ"מ | תא״ל דניאל מילוא | 2006 – 2009 | הכנת המערך לעידן ההגנה הרב־שכבתית. |
| מהגנ"א
(מפקד מערך ההגנה האווירית) |
תא״ל דורון גביש | 2009 – 2012 | קליטת כיפת ברזל, מנ"מ להגנ"א, שילוב מערכות "השותף", פליטת הברקן וסיום עידן המתנייע |
| מהגנ"א | תא״ל שחר שוחט | 2012 – 2015 | מבצע צוק איתן |
| מהגנ"א | תא״ל צביקה חיימוביץ׳ | 2015 – 2018 | קליטת חץ 3, קליטת קלע דוד |
| מהגנ"א | תא״ל רן כוכב | 2018 – 2021 | הרחבת יכולות ההגנה האווירית |
| מהגנ"א | תא״ל גלעד בירן | 2021 – 2025 | מלחמת חרבות ברזל, עם כלביא |
| מהגנ"א | תא״ל קובי רגב | מיולי 2025 | מלחמת חרבות ברזל, שאגת הארי, קליטת "אור איתן" |
תולדות מערך ההגנ״א